A zsidó vallástudományi doktori képzés célja önálló, eredeti tudományos teljesítményre képes kutatók képzése a zsidó vallástudomány területén. A program a zsidó vallási hagyomány forrásainak és történeti alakulásának kritikai vizsgálatára épül, ugyanakkor kiterjed a zsidó közösségek társadalmi, kulturális és intézménytörténeti összefüggéseinek elemzésére is. A kutatások fókuszában állhat többek között a bibliai és rabbinikus irodalom filológiai és történeti elemzése, a zsidó vallási gondolkodás teológiai és vallástudományi értelmezése, a magyarországi és közép-európai zsidóság történetének, művelődéstörténetének és társadalmi folyamatainak vizsgálata.
A doktori képzés két nagy (képzési és kutatási, valamint kutatási és disszertációs) szakasza során nyolc aktív félév alatt összesen 240 kreditet kell teljesíteni, megfelelő elosztásban. A negyedik aktív félév végén sikeres komplex vizsgát tevő doktorandusznak három éve van a disszertáció leadására (ami további egy évvel – kérelemre – meghosszabbítható). Ezután, műhelyvitát és nyilvános vitát követően a fokozatszerzés doktori (PhD) oklevél szerzésével zárul.
A doktori fokozat feltétele olyan disszertáció benyújtása és nyilvános védése, amely új tudományos eredményt mutat fel, és hozzájárul a zsidó vallástudomány, valamint a zsidó tudományok nemzetközi diskurzusához.